2007年11月，交通部和山东省人民政府联合公布《中华人民共和国交通部关于共建山东交通学院的意见》。

2009年，山东省政府批准为山东省船舶与海洋工程专业人才教育培训基地，山东省教育厅批准为山东省首批研究生联合培养基地单位。

2011年，成功获批培养硕士专业学位研究生试点工作单位，包括交通运输工程、船舶与海洋工程两个领域涉及船舶与海洋结构物设计制造、船舶电子电气与轮机工程、海洋运输与物流工程、游艇邮轮工程、车船运行安全与节能环保、港航路桥及隧道工程等六个专业方向。

2013年，山东省教育厅、财政厅发布《关于公布山东省高等教育名校建设工程第二批立项建设单位的通知》，山东交通学院获批成为“山东特色名校工程”重点建设的应用型人才培养特色高校。同年，获批教育部重点研究项目“应用科技大学改革试点战略研究”项目首批试点院校。[6